صادرات کالاها و خدمات اعم از معاف و غیر معاف به خارج از کشور از طریق مبادی خروجی رسمی مشمول مالیات و عوارض موضوع این قانون نمی باشد . مالیات و عوارض پرداخت شده بابت آن ها با ارائه برگه خروجی صادره توسط گمرک ( در مورد کالا) و اسناد و مدارک مثبته به اداره کل امور مالیاتی ذیربط مسترد می گردد .. همچنین مالياتهاي پرداختي بابت کالاهاي همراه مسافران تبعه کشورهاي خارجي که از تاريخ خريد آنها تا تاريخ خروج از کشور بيش از دوماه نگذشته باشد، از محل وصولي هاي جاري درآمد مربوط هنگام خروج از کشور در مقابل ارائه اسناد ومدارک مثبته مشمول استرداد می گردد.
مأخذ محاسبه ماليات واردات کالا، عبارت است از ارزش گمرکي کالا (قيمت خريد، هزينه حمل ونقل وحق بيمه) به علاوه حقوق ورودي (حقوق گمرکي وسود بازرگاني) مندرج در اوراق گمرکي. همچنین مأخذ محاسبه ماليات واردات خدمت، عبارت است از معادل ارزش ريالي مربوطه به مابه ازاء واردات خدمت مزبور. محاسبه مالیات و عوارض بر مبنای ارقام فوق خواهد بود حسابداری آن نیز مانند حسابداری مالیات بر ارزش افزوده می باشد که قبلا توضیح داده شده است.